戦いの傷が癒えぬまま、虎杖悠仁、伏黒恵、釘崎野薔薇は新たな任務を命じられる。今回の任務は、原因不明の大量失踪事件の調査であり、その背後には人間の心の闇を利用する呪霊の存在が囁かれていた。悠仁は事件の真相を追う中で、「呪いとは何か」「人を救うとは何か」という問いに改めて向き合う。伏黒は冷静に状況を分析し、釘崎は迷いながらも前を向き進む。三人の成長と覚悟が静かに重なり合う一方で、暗闇の中では新たな強大な脅威が静かに動き始めていた――それは、彼らの信念を試す、これまでで最も過酷な呪術戦の幕開けだった。
第242話では、タカバの術式「魂の共鳴」が明かされ、彼の想像力が現実化してケンジャクを翻弄する。二人はコメディの舞台のような戦いを繰り広げ、新たな戦い方が提示される。
渋谷での激闘からしばらく経ち、虎杖悠仁たちはそれぞれ成長を遂げつつ、京都校との交流会（対抗戦）に向けた準備を進めていた。伏黒恵と釘崎野薔薇は実戦訓練を通じて互いの力を高め合い、悠仁も七海建人との修行で得た経験を糧に、呪力の制御と戦闘技術をさらに磨いていく。一方、京都校では、東堂葵、加茂憲紀、三輪霞など個性豊かなメンバーが登場し、東京校との対抗戦に向けて士気を高めていた。しかしその裏では、呪霊側が交流会を狙い、暗躍する不穏な動きを見せており、平穏な日常の背後には確実に迫る闇の影が存在していた――。呪術廻戦の物語は、友情と成長、そして迫りくる危機が交錯する新たな章へと突入する。
ついに宿儺が倒され、悠仁はその残骸を握りしめ、「お前は俺だ」と語りかける。しかし宿儺はそれを拒絶し、自らが呪いであることを宣言したまま崩れ落ちる。裏梅（ウラウメ）もその敗北を察して消滅し、戦いの覇権はついに呪術師側に移る。戦いが終わった後、伏黒恵は目を覚まし、悠仁と野薔薇と再会を果たす。さらに、五条からの手紙が届き、恵には父・東堂の真実が、野薔薇には母の行方が明かされることで、彼らの新たな未来への道が示される。
第198話では、禪院直哉が強力な領域展開を発動し、戦場を支配しようとする。しかし、呪力を持たない真希はその効果を受けることなく行動し、死角となる背後から一気に反撃へ転じる。迷いのない一振りで直哉を討ち果たし、真希は呪霊すら凌駕する圧倒的な強さを見せつけて戦いに終止符を打つ。
虎杖は東堂の援護を受けながら、怒りと覚悟を力に変え、真人に決定的な一撃を放つ。真人は形態変化と術式で必死に抵抗するが、虎杖の成長した力と強い決意の前に次第に追い詰められていく。渋谷の戦場で繰り広げられる二人の死闘は、ついに勝敗が決まる決定的な局面へと突入していた――。
虎杖と東堂の連携によって、真人はついに追い詰められ、攻撃の自由を奪われ始める。虎杖は怒りと正義感を力に変え、宿儺の力を抑えつつ冷静に攻撃のチャンスを狙う。真人は追い詰められつつも術式を駆使して反撃を試みるが、二人の連携と判断力に押され、戦局は渋谷の中心で決定的な局面を迎えようとしていた――。